אין ראיה מאומתת לכך שחייזרים נמצאים באזור 51. יש תיאוריות שלפיהן מוחזקים בבסיס חייזרים או טכנולוגיה חוצנית, אבל אין להן אישור רשמי או ראיות פיזיות מוסכמות; ממשלת ארצות הברית לא אישרה שקיימים בו חוצנים או חלליות [1].
מה שכן מתועד הוא השימוש באזור 51 לניסויים במטוסי ריגול. מסמכים שנחשפו לציבור מעידים שהבסיס שימש לניסוי מטוסים כמו U-2 ו-A-12, וסרט תיעודי באתר עוסק בקשר האפשרי בין מטוסי ריגול סודיים לבין תעלומות עב״מים [1][2]. זה מספק הסבר אפשרי לחלק מהדיווחים על עצמים חריגים בשמיים, אך לא מוכיח שכל תצפית באזור זוהתה [1][2].
גם סרטון שמוצג באתר כצילום של כלי משולש לכאורה ליד אזור 51 אינו הוכחה לנוכחות חייזרים: הפרסום מתאר טענה של המעלה שהעצם נראה כאילו הוא מתחיל ״להשתגר״, והוא עצמו אינו בטוח אם הסרטון אמיתי [3]. הייעוד הצבאי העכשווי של הבסיס עדיין מסווג, והגישה אליו סגורה לציבור [1]. לכן מה שלא ידוע לציבור הוא מה מתרחש כיום בבסיס; אין במידע שפורסם כאן ראיה שמאפשרת לקבוע שיש בו חייזרים [1].